Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms