Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VLDLRP98155 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms