Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms