Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS3AP61247 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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