Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNAP25P60880 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms