Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCCD1P59942 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms