Protein–RNA interactions for Protein: P58743

SLC26A5, Prestin, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A5P58743 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A5P58743 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A5P58743 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A5P58743 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A5P58743 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A5P58743 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A5P58743 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A5P58743 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC26A5P58743 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC26A5P58743 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC26A5P58743 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms