Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NME5P56597 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms