Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms