Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGDP52209 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGDP52209 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms