Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NESP48681 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NESP48681 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NESP48681 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NESP48681 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NESP48681 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NESP48681 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NESP48681 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NESP48681 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NESP48681 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NESP48681 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NESP48681 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NESP48681 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NESP48681 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NESP48681 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NESP48681 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NESP48681 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NESP48681 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NESP48681 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NESP48681 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NESP48681 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms