Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5OP48047 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5OP48047 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms