Protein–RNA interactions for Protein: P47872

SCTR, Secretin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCTRP47872 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCTRP47872 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCTRP47872 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCTRP47872 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCTRP47872 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCTRP47872 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCTRP47872 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCTRP47872 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms