Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NBL1P41271 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NBL1P41271 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NBL1P41271 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms