Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms