Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPS1P31327 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPS1P31327 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms