Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5DP30049 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms