Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms