Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms