Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms