Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP5F1P24539 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms