Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRGP23470 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRGP23470 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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