Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LHCGRP22888 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms