Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALB2P22676 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALB2P22676 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALB2P22676 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALB2P22676 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CALB2P22676 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms