Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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