Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRFP10586 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRFP10586 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms