Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC166P0CW27 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms