Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD63P08962 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD63P08962 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD63P08962 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD63P08962 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD63P08962 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD63P08962 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD63P08962 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD63P08962 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD63P08962 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD63P08962 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD63P08962 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD63P08962 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD63P08962 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD63P08962 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms