Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYBBP04839 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYBBP04839 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYBBP04839 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYBBP04839 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYBBP04839 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYBBP04839 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYBBP04839 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYBBP04839 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYBBP04839 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms