Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPLO60437 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPLO60437 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPLO60437 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPLO60437 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPLO60437 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms