Protein–RNA interactions for Protein: O43916

CHST1, Carbohydrate sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST1O43916 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHST1O43916 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHST1O43916 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHST1O43916 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHST1O43916 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHST1O43916 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHST1O43916 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CHST1O43916 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHST1O43916 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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