Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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