Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD1AO15047 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms