Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BHLHE40O14503 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms