Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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