Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GOLGA8SH3BPF8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GOLGA8SH3BPF8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms