Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4DXG7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4DXG7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DXG7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DXG7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DXG7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DXG7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DXG7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DXG7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DXG7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DXG7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DXG7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DXG7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DXG7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4DXG7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
B4DXG7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms