Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB19A4D1S5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB19A4D1S5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB19A4D1S5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB19A4D1S5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB19A4D1S5 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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RAB19A4D1S5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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