Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CPED1A4D0V7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms