Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX2A2RU54 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMX2A2RU54 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms