Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms