Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms