Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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