Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms