Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms