Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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COMMD8Q9NX08 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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