Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms