Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms