Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLMPQ9H6B4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms