Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL627171.2-201ENST00000635177 1090 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL47-203ENST00000476781 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMTN-201ENST00000339336 1037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETD4-203ENST00000399205 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2H-202ENST00000429568 878 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms